Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisal2aA2A9G7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal2aA2A9G7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms