Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo47A2A6H3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo47A2A6H3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms