Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm27029A2A4P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm27029A2A4P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms