Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp1bA1Z198 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp1bA1Z198 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms