Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trav12-2A0N8N6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trav12-2A0N8N6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trav12-2A0N8N6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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