Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms