Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1I1

Igkv16-104, Immunoglobulin kappa variable 16-104 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv16-104A0A0B4J1I1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igkv16-104A0A0B4J1I1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms