Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Gm28576A0A087WRP6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28576A0A087WRP6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gm28576A0A087WRP6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gm28576A0A087WRP6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Gm28576A0A087WRP6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Gm28576A0A087WRP6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Gm28576A0A087WRP6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28576A0A087WRP6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28576A0A087WRP6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28576A0A087WRP6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Gm28576A0A087WRP6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Gm28576A0A087WRP6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28576A0A087WRP6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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