Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,82■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16,8■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Trdv1A0A075B657 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16,75■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16,73■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Trdv1A0A075B657 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Trdv1A0A075B657 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
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