Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5538W4VSP6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5538W4VSP6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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