Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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