Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms