Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sh3bp5Q9Z131 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sh3bp5Q9Z131 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sh3bp5Q9Z131 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5Q9Z131 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5Q9Z131 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Sh3bp5Q9Z131 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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