Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdh20Q9Z0M3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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