Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms