Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv2Q9WTR1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms