Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf4Q9QZS2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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