Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms