Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms