Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms