Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tcea2Q9QVN7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tcea2Q9QVN7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tcea2Q9QVN7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tcea2Q9QVN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tcea2Q9QVN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tcea2Q9QVN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms