Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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