Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tgm1Q9JLF6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms