Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nectin3Q9JLB9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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