Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod2Q9JKK7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod2Q9JKK7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod2Q9JKK7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod2Q9JKK7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmod2Q9JKK7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmod2Q9JKK7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Tmod2Q9JKK7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tmod2Q9JKK7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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