Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnq4Q9JK97 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnq4Q9JK97 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms