Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmg1Q9JK23 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms