Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms