Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scube2Q9JJS0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scube2Q9JJS0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms