Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms