Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms