Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prpf4Q9DAW6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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