Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrmuQ9DAT5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrmuQ9DAT5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms