Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms