Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms