Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms