Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
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