Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms