Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rexo2Q9D8S4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms