Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms