Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp2bpQ9D4C6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp2bpQ9D4C6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms