Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms