Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Batf3Q9D275 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Batf3Q9D275 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms