Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hddc3Q9D114 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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