Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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