Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms