Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcf1Q9CTH6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcf1Q9CTH6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcf1Q9CTH6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fcf1Q9CTH6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fcf1Q9CTH6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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