Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms