Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ8

Lsm7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm7Q9CQQ8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm7Q9CQQ8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lsm7Q9CQQ8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lsm7Q9CQQ8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm7Q9CQQ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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