Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms